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Vamos a utilizar los datos de Gutiérrez-Ríos et al. (2004), accesibles desde
aquí,
para este ejercicio. La idea es que os copiéis el archivo plano con los datos a vuestra
máquina local y os pido que escribáis un programa que:
- almacene en memoria los perfiles de expresión de los genes como una tabla asociativa
donde cada llave (Bnumber o nombre) devuelva como valor un arreglo de 4 valores con
la expresión en heat shock, en stationary phase, en anaerobic growth y el valor
umbral o cutoff.
- partiendo de los genes
menE, cyoA y flgL
, seleccione mediante coeficientes
de correlación los genes cuyo patrón de expresión se parezca. Os sugiero que uséis el
módulo
Stats.
- represente gráficamente los patrones de expresión de estos 3 grupos de genes, usando
el paquete GD::Graph (sección 3.4.6).
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Bruno Contreras Moreira
2007-06-15