La estructura secundaria de las moléculas de RNA, sostenida por medio de puentes de hidrógeno entre nucleótidos, puede aproximarse a partir del conocimiento de la secuencia. Una de sus principales aplicaciones es el descubrimiento de RNAs no codificantes, que pueden tener funciones biológicas importantes, como se discute en este artículo de Washietl et al. (2005).
En esta clase la idea es explorar el paquete de programas Vienna para estudiar la estructura secundaria de moléculas de RNA (puede ser útil revisar este tutorial para recordar la teoría). Se sugiere para el trabajo en clase trabajar con dos ejemplos: