Ejercicio propuesto

Después de las últimas sesiones creo que ya estáis preparados para un ejercicio de modelado real. En concreto os pido que:

• selecciona una secuencia del proyecto de secuenciación que prefieras (TIGR)
• haz una búsqueda con las estrategias que más te gusten de estructuras molde. Si no encuentras moldes ni haciendo fold recognition, elige otra secuencia.
• construye al menos un modelo comparativo con los al menos uno de los moldes encontrados. Si hubiera diferentes alineamientos posibles prueba con varios de ellos.
• estima la calidad de tu modelo usando un servidor como Verify3D
• si la calidad es aceptable, propón posibles mutaciones que podrían afectar a la estabilidad de la proteína. Por ejemplo, los resíduos que más contactos tengan con otros resíduos son buenos candidatos.
• haz un reporte muy breve de todos estos pasos