REM -------------------------------------------------------------------- ing REM ing REM STRIDE: Knowledge-based secondary structure assignment ing REM Please cite: D.Frishman & P.Argos, Proteins XX, XXX-XXX, 1995 ing REM ing REM Residue accessible surface area calculation ing REM Please cite: F.Eisenhaber & P.Argos, J.Comp.Chem. 14, 1272-1280, 1993 ing REM F.Eisenhaber et al., J.Comp.Chem., 1994, submitted ing REM ing REM ------------------------ General information ----------------------- ing REM ing HDR amed_protein_from_Tetraodon_nigroviridis modelled using 1lfu ing REM ing REM -------------------- Secondary structure summary ------------------- ing REM ing CHN pdbfile.data P ing REM ing REM . . . . . ing SEQ 1 KNATRESTSTLKAWLSEHRKNPYPTKGEKIMLAIITKMTLTQVSTWFANA 50 ing STR TTTTHHHHHHHHHHHHTTTTTT HHHHHHHHHHH HHHHHHHHHHH ing REM ing REM . ing SEQ 51 RRRLKKERNRTDEEGNVYS 69 ing STR HHHHHHHHHHHHHHHHHH ing REM ing REM ing REM ing LOC AlphaHelix ARG 10 P SER 21 P ing LOC AlphaHelix LYS 28 P THR 38 P ing LOC AlphaHelix LEU 42 P TYR 70 P ing LOC TurnIV LYS 6 P THR 9 P ing LOC TurnIV SER 21 P ARG 23A P ing LOC TurnI HIS 23 P ASN 23C P ing LOC TurnVIII ARG 23A P PRO 24 P ing REM ing REM --------------- Detailed secondary structure assignment------------- ing REM ing REM |---Residue---| |--Structure--| |-Phi-| |-Psi-| |-Area-| ing ASG LYS P 6 1 T Turn 360.00 -48.64 128.1 ing ASG ASN P 7 2 T Turn -55.27 -98.10 74.6 ing ASG ALA P 8 3 T Turn -57.00 100.49 78.3 ing ASG THR P 9 4 T Turn -68.35 176.41 42.8 ing ASG ARG P 10 5 H AlphaHelix -55.72 -20.13 79.9 ing ASG GLU P 11 6 H AlphaHelix -75.29 -47.70 55.1 ing ASG SER P 12 7 H AlphaHelix -63.82 -41.71 19.4 ing ASG THR P 13 8 H AlphaHelix -56.24 -55.04 49.3 ing ASG SER P 14 9 H AlphaHelix -54.99 -40.55 62.6 ing ASG THR P 15 10 H AlphaHelix -72.72 -55.64 49.4 ing ASG LEU P 16 11 H AlphaHelix -59.32 -42.98 50.4 ing ASG LYS P 17 12 H AlphaHelix -60.60 -53.36 48.3 ing ASG ALA P 18 13 H AlphaHelix -46.45 -43.65 33.8 ing ASG TRP P 19 14 H AlphaHelix -76.89 -38.29 54.0 ing ASG LEU P 20 15 H AlphaHelix -52.19 -48.57 41.9 ing ASG SER P 21 16 H AlphaHelix -63.66 11.02 56.1 ing ASG GLU P 22 17 T Turn -114.17 -23.22 71.9 ing ASG HIS P 23 18 T Turn -121.85 34.68 32.2 ing ASG ARG P 23A 19 T Turn -46.42 -56.79 59.5 ing ASG LYS P 23B 20 T Turn -58.21 -7.54 99.0 ing ASG ASN P 23C 21 T Turn -142.53 75.13 42.7 ing ASG PRO P 24 22 T Turn -63.88 48.93 56.3 ing ASG TYR P 25 23 C Coil -154.80 122.53 49.5 ing ASG PRO P 26 24 C Coil -51.45 -150.57 73.8 ing ASG THR P 27 25 C Coil -145.82 168.82 42.5 ing ASG LYS P 28 26 H AlphaHelix -50.26 -52.45 78.9 ing ASG GLY P 29 27 H AlphaHelix -70.78 -29.78 66.2 ing ASG GLU P 30 28 H AlphaHelix -65.51 -55.62 41.6 ing ASG LYS P 31 29 H AlphaHelix -59.18 -23.40 20.8 ing ASG ILE P 32 30 H AlphaHelix -75.75 -60.51 45.2 ing ASG MET P 33 31 H AlphaHelix -58.58 -48.77 51.7 ing ASG LEU P 34 32 H AlphaHelix -54.71 -61.36 44.9 ing ASG ALA P 35 33 H AlphaHelix -55.02 -30.34 17.9 ing ASG ILE P 36 34 H AlphaHelix -76.37 -46.32 63.1 ing ASG ILE P 37 35 H AlphaHelix -66.95 -46.69 71.3 ing ASG THR P 38 36 H AlphaHelix -73.94 -52.35 32.0 ing ASG LYS P 39 37 C Coil 115.85 19.33 69.5 ing ASG MET P 40 38 C Coil -107.59 -163.51 55.6 ing ASG THR P 41 39 C Coil -121.15 143.34 45.1 ing ASG LEU P 42 40 H AlphaHelix -26.38 -74.45 40.7 ing ASG THR P 43 41 H AlphaHelix -44.02 -31.63 75.3 ing ASG GLN P 44 42 H AlphaHelix -67.44 -37.73 49.0 ing ASG VAL P 45 43 H AlphaHelix -56.30 -54.87 43.8 ing ASG SER P 46 44 H AlphaHelix -55.97 -27.52 48.6 ing ASG THR P 47 45 H AlphaHelix -73.51 -51.95 51.4 ing ASG TRP P 48 46 H AlphaHelix -57.26 -56.41 51.8 ing ASG PHE P 49 47 H AlphaHelix -48.00 -55.90 38.9 ing ASG ALA P 50 48 H AlphaHelix -47.15 -38.70 46.5 ing ASG ASN P 51 49 H AlphaHelix -71.98 -32.14 48.5 ing ASG ALA P 52 50 H AlphaHelix -59.75 -45.68 51.3 ing ASG ARG P 53 51 H AlphaHelix -60.63 -44.93 57.9 ing ASG ARG P 54 52 H AlphaHelix -55.68 -62.00 54.5 ing ASG ARG P 55 53 H AlphaHelix -49.72 -31.97 60.0 ing ASG LEU P 56 54 H AlphaHelix -57.11 -60.09 29.4 ing ASG LYS P 57 55 H AlphaHelix -46.27 -17.41 76.8 ing ASG LYS P 58 56 H AlphaHelix -81.09 -38.59 73.5 ing ASG GLU P 59 57 H AlphaHelix -135.53 41.62 42.4 ing ASG ARG P 60 58 H AlphaHelix -13.86 -72.05 47.5 ing ASG ASN P 61 59 H AlphaHelix -52.58 -23.19 75.7 ing ASG ARG P 62 60 H AlphaHelix -74.21 -38.79 62.2 ing ASG THR P 63 61 H AlphaHelix -80.23 -29.09 43.3 ing ASG ASP P 64 62 H AlphaHelix -56.97 -65.83 50.5 ing ASG GLU P 65 63 H AlphaHelix -51.57 -42.56 60.0 ing ASG GLU P 66 64 H AlphaHelix -59.31 -51.23 41.0 ing ASG GLY P 67 65 H AlphaHelix -43.72 -41.39 33.0 ing ASG ASN P 68 66 H AlphaHelix -74.31 -36.64 62.0 ing ASG VAL P 69 67 H AlphaHelix -62.27 -60.45 65.9 ing ASG TYR P 70 68 H AlphaHelix -66.45 -32.08 55.9 ing ASG SER P 71 69 C Coil -56.91 360.00 87.3 ing